Институт образован в 1968 году и имеет 51-летний опыт работы в области прогнозирования и исследования макроэкономических, монетарных, финансово-банковских и социальных проблем. За время своей деятельности цели и задачи Института менялись с учетом требований времени:
Научно-исследовательский экономический институт (1968 г.);
Научно-исследовательский институт экономики и нормативов с Вычислительным центром (1986 г.);
Научно-исследовательский институт экономики и статистики (1992 г.);
Научно-исследовательский институт экономики и развития производительных сил (1994 г.);
Институт макроэкономических и социальных исследований (1997 г.);
Центр эффективной экономической политики (2000 г.);
Центр социально-экономических исследований (2005 г.).
В 2008 году был преобразован в Институт прогнозирования и макроэкономических исследований при Кабинете Министров, с 2018 года – при Министерстве экономики и финансов. С 2023 года согласно Постановлению Президента Республики Узбекистан №ПП-108 от 4 апреля 2023 года «О мерах по расширению научных подходов и дальнейшему совершенствованию системы подготовки управленческих кадров в реализации экономических реформ» преобразован в Институт макроэкономических и региональных исследованийпри Кабинете Министров.
В Институте работали 4академика, более 30докторов наук и профессоров, более 100кандидатов экономических наук. Сотрудники Института участвовали в подготовке Декларации о независимости Республики Узбекистан.
В настоящее время Институт активно участвует в реализации Стратегии развития Нового Узбекистана на 2022-2026 годы, подготовке концепций и стратегий развития отраслей, регионов и основных сфер экономики, проводит исследования макроэкономических и региональных процессов для обоснования мер и предложений, а также прогнозных параметров по актуальным проблемам отечественной экономики.
Институт оказывает методологическую и методическую поддержку Кабинету Министров Республики Узбекистан.
Институт сотрудничает с многими зарубежными организациями, в частности, со Всемирным Банком, представительством GIZ в Республике Узбекистан, АБР, ПРООН и др.